Шестой год обучения в Хогвартсе начинается с тревожных новостей: тёмные силы всё активнее проникают в мир обычных людей, и даже стены школы больше не кажутся безопасными. Гарри всё сильнее подозревает, что среди преподавателей и учеников затаился предатель, связанный с Волан-де-Мортом. В то же время Дамблдор решает посвятить юного волшебника в тайны прошлого тёмного лорда, используя для этого воспоминания из старых знакомых.
Параллельно Гарри находит старый учебник зельеварения с пометками загадочного бывшего студента, называющего себя Принцем-полукровкой. Записи в книге содержат множество полезных заклинаний и хитростей, которые помогают парню добиться успехов на уроках Снейпа. Однако вместе с этим Гарри начинает замечать странное поведение Драко Малфоя, который явно что-то замышляет в стенах замка.
Дамблдор показывает Гарри несколько важных воспоминаний о юности Тома Реддла, раскрывая секреты создания крестражей — предметов, хранящих части души тёмного мага. Чтобы уничтожить один из них, директор отправляется с Гарри в опасное путешествие, оставляя школу под защитой других преподавателей. Во время их отсутствия Малфой приводит в замок отряд Пожирателей смерти, и начинается жестокая битва.
В ходе сражения Снейп убивает Дамблдора, раскрывая свою истинную преданность. Гарри понимает, что именно Снейп был тем самым Принцем-полукровкой, оставившим следы в учебнике. Юноша остаётся один перед лицом надвигающейся войны, зная, что впереди его ждёт решающая схватка с Волан-де-Мортом.